Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms