Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP15Q9Y4E8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP15Q9Y4E8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms