Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms