Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms