Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT82Q9NSB4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms