Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MMP26Q9NRE1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MMP26Q9NRE1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms