Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ASCL3Q9NQ33 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms