Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms