Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSD3Q9BZ95 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms