Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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