Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms