Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCP2Q9BX26 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCP2Q9BX26 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms