Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms