Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USB1Q9BQ65 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms