Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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