Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms