Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms