Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SAMD8Q96LT4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAMD8Q96LT4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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