Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCARF2Q96GP6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCARF2Q96GP6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms