Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC35A4Q96G79 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms