Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SMIM12Q96EX1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SMIM12Q96EX1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SMIM12Q96EX1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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