Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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