Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG4Q92954 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms