Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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PTPRUQ92729 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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PTPRUQ92729 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRUQ92729 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
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