Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RNF138Q8WVD3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF138Q8WVD3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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