Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms