Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms