Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHMP1BQ7LBR1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms