Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRN1Q6UXK5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRN1Q6UXK5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms