Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A1Q6PCB7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms