Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms