Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms