Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC18A3Q16572 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC18A3Q16572 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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