Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNA6Q15825 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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