Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPTX1Q15818 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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