Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEBPEQ15744 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms