Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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