Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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