Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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