Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3CQ13748 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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