Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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