Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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