Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGDRQ13258 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGDRQ13258 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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