Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TWF1Q12792 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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