Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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KCNMA1Q12791 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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KCNMA1Q12791 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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KCNMA1Q12791 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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KCNMA1Q12791 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNMA1Q12791 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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