Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGNL1Q0VF96 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms