Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPAL4Q0D2K0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms