Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EP300Q09472 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EP300Q09472 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EP300Q09472 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EP300Q09472 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms