Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms