Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CENPEQ02224 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms